...No te hagas ilusiones, que yo no lo sé
Lo que sí te puedo decir es que he probado muchos -sobre todo los gratuitos- y son un auténtico desastre, casi ninguno funciona y los que llegan a convertir lo hacen muy mal, perdiendo mucha calidad.
Lo único que me ha funcionado es importarlos desde Premiere Pro CS6, renderizarlos a H264 y luego exportarlos ya al formato que quieras. Para eso tienes que tener instalados todos los codecs y complementos (que son opcionales).
A ver si algún experto nos da una solución más sencilla...